研究者对家猫、野猫以及另外几种哺乳动物的基因组进行了比对。结果发现，和野猫相比，家猫基因中与记忆、恐惧调节、刺激-奖励学习有关的基因出现了改变；另外，家猫基因中和脂类代谢有关的基因也出现了变异。

家猫是一种常见的宠物，而考古证据显示，在约9500年前的塞浦路斯和约5000年前的中国中部，人类就已经开始和这些可爱的喵星人生活在一起了。以往的研究多关注于家猫品种间的差异、家猫的系统发育起源以及家猫与野猫之间的基因渗入程度（指两个基因库间的基因流动，通常通过中间杂交产生）。

然而，对于驯化过程如何改变现代家猫的遗传特征，以及家猫与其它家养动物的不同之处，人们所知甚少。因此，研究者通过对猫基因组的分析和比较，来寻找驯化过程留下的分子足迹。

首先，研究者对一只阿比西尼亚猫的全基因组进行了测序，找出其中的功能基因。然后又将这些基因与虎、狗、牛和人类中的类似基因相比较，确定了食肉动物、猫科动物以及家猫中受到正向选择（因为对物种有益而被保留）的基因。那么这些基因对猫的重要性体现在何处呢？

研究者找到了其中有6个可以增加猫听觉灵敏度的基因，而这些基因的突变会导致耳聋；另外，还存在可以增加视觉灵敏度的基因，这对于猫这种在黎明和黄昏时捕猎的动物来非常重要，而人类中相应基因的突变则与一系列视觉病症相关。

实验结果还显示，猫与脂类代谢相关的基因也发生了改变。与大多数食肉动物不同，猫是专性肉食动物，这导致它们无法合成某些必须氨基酸，因此它们可能演化出了不同的脂类代谢途径。此外，猫虽然会进食大量脂肪酸，但却不会对血脂浓度造成影响，而同样的情况在人类当中就可能引发心血管疾病。

为了防止单一品种家猫的基因组中存在品种形成时产生的遗传漂变从而对实验造成影响，研究者综合了分析其它6个家猫品种基因，包括缅因猫、挪威森林猫、缅甸猫、日本短尾猫、土耳其梵猫和埃及猫。

研究表明，缅甸猫的一个基因可能经历了快速的遗传变化，这个基因负责控制毛发的白点图案。家猫的繁殖者着重于这个特征的选育，在这个品种中就产生了其它品种中所没有的固定变异。这种对某个特征的选育过程也可能引起了各个品种家猫中常见健康问题，许多兽医对这个现象很感兴趣，希望用基因组学的方法来找出背后的原因。”

通过进一步对比家猫和两种野猫（欧洲野猫和非洲野猫）的基因组，研究者发现与野猫相比，家猫有关记忆形成、恐惧调节和刺激-奖励学习相关的基因发生了改变，尤其是其中与食物奖励相关的基因。

与重组相关的基因在家猫中也有所增加，而以往的研究结果显示，家猫与其它哺乳动物相比，基因重组率更高，这可能是它们产生多样性的一个机制。

另外，与胚胎发育过程中神经嵴形成的相关基因也出现了改变，而这与“驯化综合特征（domestication syndrome）”假说相符——该假说认为，哺乳动物驯化过程中形态和生理特征的改变是神经嵴细胞轻度不足所导致。